中国科学技术大学知网查重的原理主要是通过文本比对技术，对上传的文档与知网数据库中的文献进行比对，从而判断文档的原创性和重复率。具体而言，系统会对文档中的文字进行分词、去除停用词等处理，然后与知网中的文献进行相似度计算，最终给出查重结果。

此外，中国科学技术大学知网查重还会考虑到文献的引用情况、篇幅分布等因素，综合判断文档的整体原创性。通过这一原理，知网查重系统能够有效检测出文档中存在的抄袭、剽窃等问题，保障学术研究的诚信性和学术水平。